Single nucleotide polymorphism, haplotypes and genotypes of Mannose-binding lectin (MBL1) gene and their association with clinical mastitis in Murrah buffalo
نویسندگان
چکیده
The Mannose-binding lectin (MBL1) gene is an important component of immune response system. It plays vital role in activation the complement system and act as chief defense molecule host cell to provide protection against various diseases. In recent study, six novel single nucleotide polymorphisms (SNPs), at 2689G>C, 2751A>G, 4822T>C, 4853A>G, 4855T>C, 4978T>C resulted 2 non synonymous type change 4855T>C resulting one amino acid substitution Ser150Gly MBL1 protein their association with clinical mastitis were investigated two hundred (200) Murrah buffaloes. These SNPs genotyped by using polymerase chain reaction (PCR) Deoxyribose nucleic (DNA) sequencing methods order reveal mastitis. SHEsis software tool was used for construction haplotypes Linkage disequilibrium analysis. Twenty (21) constructed. Allelic analysis showed that C allele 2689 G>C, A 2751 A>G, 4822 T>C, 4853 4855 4978 T>C had significant increased risk buffaloes (P<0.05). CG genotype AG or GG CC TC loci significantly lower incidence compared counter genotypes. Haplotype Hap21 (TATTGA) found related higher Hap14 (TGTTGG) Hap5 (CGCCCA) associated buffalo
منابع مشابه
the study of aaag repeat polymorphism in promoter of errg gene and its association with the risk of breast cancer in isfahan region
چکیده: سرطان پستان دومین عامل مرگ مرتبط با سرطان در خانم ها است. از آنجا که سرطان پستان یک تومور وابسته به هورمون است، می تواند توسط وضعیت هورمون های استروئیدی شامل استروژن و پروژسترون تنظیم شود. استروژن نقش مهمی در توسعه و پیشرفت سرطان پستان ایفا می کند و تاثیر خود را روی بیان ژن های هدف از طریق گیرنده های استروژن اعمال می کند. اما گروه دیگری از گیرنده های هسته ای به نام گیرنده های مرتبط به ا...
15 صفحه اولDNA Polymorphisms at Candidate Gene Loci and Their Relation with Milk Production Traits in Murrah Buffalo (Bubalus bubalis)
DNA polymorphism within diacylglycerol transferase 2 (DGAT2) / monoacyl glycerol transferases 2 (MOGAT2), leptin and butyrophilin genes were analysed using PCR-SSCP in Murrah buffalo. The single strand conformation polymorphism (SSCP) analysis of amplified gene fragment in exon 5 of MOGAT2, exon 3 of leptin and intron 1 of butyrophilin gene revealed different patterns. A, B and C showed the fol...
متن کاملSingle nucleotide polymorphism of the lactoferrin gene and its association with milk production and reproduction traits in Iranian Holstein cattle
Bovine lactoferrin (LTF) is a member of the transferrin family of iron-binding proteins. This protein is present in a wide variety of biological fluids and shows important physiological functions in body. In this study, 404 blood samples were collected from Holstein dairy farms in Iran. A 301 bp fragment of intron 6 in bovine LTF gene was amplified and the animals were genotyped using polymeras...
متن کاملinvestigation of single-user and multi-user detection methods in mc-cdma systems and comparison of their performances
در این پایان نامه به بررسی روش های آشکارسازی در سیستم های mc-cdma می پردازیم. با توجه به ماهیت آشکارسازی در این سیستم ها، تکنیک های آشکارسازی را می توان به دو دسته ی اصلی تقسیم نمود: آشکارسازی سیگنال ارسالی یک کاربر مطلوب بدون در نظر گرفتن اطلاعاتی در مورد سایر کاربران تداخل کننده که از آن ها به عنوان آشکارساز های تک کاربره یاد می شود و همچنین آشکارسازی سیگنال ارسالی همه ی کاربران فعال موجود در...
ذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Buffalo Bulletin
سال: 2023
ISSN: ['0125-6726']
DOI: https://doi.org/10.56825/bufbu.2023.4225055